Głównym celem „Biegu do Serca” jest uczczenie Bożego Miłosierdzia i szerzenie jego kultu. To odpowiedź na słowa św. Jana Pawła II: „Trzeba tę iskrę Bożej łaski rozniecać. Trzeba przekazywać światu ogień miłosierdzia. W miłosierdziu Boga świat znajdzie pokój, a człowiek szczęście! To zadanie powierzam wam, drodzy bracia i siostry. Bądźcie świadkami miłosierdzia”. Forma głoszenia miłosierdzia przez bieg przyszła natomiast po słowach papieża Franciszka wypowiedzianych w ubiegłym roku na plaży Copacabana w Rio „Bądźcie atletami Chrystusa!”.